logo UG

Bibliografia Publikacji Pracowników, Doktorantów i Studentów UG




Zapytanie: GANZYNKOWICZ ROBERT
Liczba odnalezionych rekordów: 15



Przejście do opcji zmiany formatu | Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetl wyniki w wersji do druku | | Przesłanie wyników do modułu analizy | Nowe wyszukiwanie
1/15
AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Marta Wiśniewska, Y. Yin, Y. He, Adam K. Sieradzan, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka Lipska, Agnieszka Karczyńska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, Artur Giełdoń, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Michał Głuski, Dawid Jagieła, Adam Liwo, Mariusz Makowski, Stanisław Ołdziej, Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski, H. A. Scheraga.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction by replica-exchange molecular dynamics simulations with the physics-based coarse-grained UNRES force field
NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
Adres url:
2/15
AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Adam K. Sieradzan, Y. He, Y. Yin, Agnieszka Lipska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, C. Kieslich, J. Smadbeck, G. Khoury, P. Tamamis, C. A. Floudas, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Robert Ganzynkowicz, Artur Giełdoń, Adam Liwo, Stanisław Ołdziej, Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski, H. A. Scheraga, S. N. Crivelli.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction by replica-exchange molecular dynamics simulations with the UNRES force field aided by secondary-structure and residue-residue contact prediction
NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
Adres url:
3/15
AUTORZY: Adam Liwo, Adam K. Sieradzan, Agnieszka G. Lipska, Robert Ganzynkowicz, Michał Głuski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A rigorous approach to derive analytical expressions for the effective energy terms in coarse-grained force fields
NAZWA KONFERENCJI: 3rd International Conference on Protein and RNA Structure Prediction
MIEJSCE: Punta Cana, Dominican Republic, 14-18 December 2015
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
4/15
AUTORZY: Adam K. Sieradzan, Agnieszka G. Lipska, Robert Ganzynkowicz, Michał Głuski, Józef Adam Liwo.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A rigorous approach to derive analytical expressions in coarse-grained force fields
NAZWA KONFERENCJI: 60th Annual Meeting of the Biophysical-Society
MIEJSCE: Los Angeles, USA, 27 February - 2 March 2016
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
5/15
AUTORZY: Robert Ganzynkowicz, Maciej Maciejczyk, Artur Giełdoń, Adam Liwo.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Determination of backbone-local potentials for the coarse-grained NARES-2P model of nucleic acids
NAZWA KONFERENCJI: Second Polish - Korean Conference on Protein Folding: Theoretical and Experimental Approaches
MIEJSCE: Leźno, Gdańsk, Poland, 28 May - 1 June 2016
ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS ; University of Gdańsk
Typ publikacji: ZXP
6/15
AUTORZY: Adam Liwo, Adam K. Sieradzan, Agnieszka G. Lipska, Robert Ganzynkowicz, Bartosz Gryta, Michał Głuski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: How do the local and long-range interactions encode the three-dimensional structures of biological macromolecules: a coarse-grained perspective
NAZWA KONFERENCJI: 6th Visegrad Symposium on Structural Systems Biology
MIEJSCE: Warsaw, Poland, 19-21 June 2016
Typ publikacji: ZXK
Język publikacji: ENG
Adres url:
7/15
AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Marta Wiśniewska, Yanping Yin, Yi He, Adam K. Sieradzan, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka G. Lipska, Agnieszka Karczyńska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, Artur Giełdoń, Cezary Czaplewski, Dawid Jagieła, Bartłomiej Zaborowski, Harold A. Scheraga, Adam Liwo.
TYTUŁ: Performance of protein-structure predictions with the physics-based UNRES force field in CASP11
ŹRÓDŁO: Bioinformatics. - 2016, Vol. 32, iss. 21, s. 3270-3278
p-ISSN: 1367-4803
e-ISSN: 1460-2059

UWAGI: Bibliogr. 62 poz.
Typ publikacji: ZAC
Język publikacji: ENG
Wskaźnik Impact Factor ISI: 7.307
Punktacja MNiSW: 45.000
5-letni Impact Factor ISI: 8.044
Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Medline
  • Scopus

    DOI:
    8/15
    AUTORZY: Robert Ganzynkowicz, Angelika Głębocka, Adam Liwo, Mariusz Makowski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Potencjał oddziaływań pomiędzy O-fosforylowaną tyrozyną a modelami polarnych łańcuchów bocznych reszt aminokwasowych w wodzie
    NAZWA KONFERENCJI: 59 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego
    MIEJSCE: Poznań, 19-23 września 2016
    Typ publikacji: PXP
    Język publikacji: ENG
    9/15
    AUTORZY: Mariusz Makowski, Angelika Głębocka, Robert Ganzynkowicz, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Potencjał opisujący oddziaływania pomiędzy O-fosforylowannymi aminokwasami z modelami hydrofobowych łańcuchów bocznych reszt aminokwasowych w wodzie
    NAZWA KONFERENCJI: 59 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego
    MIEJSCE: Poznań, 19-23 września 2016
    Typ publikacji: PXK
    Język publikacji: ENG
    10/15
    AUTORZY: Robert Ganzynkowicz, Angelika Głębocka, Adam Liwo, Mariusz Makowski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Simple analytical formulas for the potentials of mean force of interactions between O-phosphorylated and hydrphobic amino-acid side-chain models in water
    NAZWA KONFERENCJI: Second Polish-Korean Conference on Protein Folding: Theoretical and experimental approaches
    MIEJSCE: Leźno, Gdańsk, Poland, 28 May - 1 June 2016
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: University of Gdańsk ; KIAS
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    11/15
    AUTORZY: Adam Liwo, Adam K. Sieradzan, Agnieszka G. Lipska, Robert Ganzynkowicz, Emilia Lubecka, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: The unified coarse-grained model for large-scale simulations of biological macromolecules
    NAZWA KONFERENCJI: 16th KIAS Conference on Protein Structure and Function
    MIEJSCE: Seoul, Korea, 22-24 September 2016
    Typ publikacji: ZXK
    Język publikacji: ENG
    12/15
    AUTORZY: P. Krupa, Agnieszka S. Karczyńska, Robert Ganzynkowicz, M. D. Wiśniewska, M. A. Mozolewska, Michał Głuski, Łukasz Golon, Y. He, Adam K. Sieradzan, Y. Yin, Rafał Ślusarz, Magdalena Ślusarz, Artur Giełdoń, Cezary Czaplewski, H. A. Scheraga, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Use of UNRES force field and replica-exchange molecular dynamics in physics-based template-free prediction of protein structures
    NAZWA KONFERENCJI: 12th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP12)
    MIEJSCE: Gaeta, Italy, 10-13 December 2016
    Typ publikacji: ZXK
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    13/15
    AUTORZY: Robert Ganzynkowicz, Adam Liwo, Mariusz Makowski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Oddziaływania pomiędzy O-fosforylowanymi aminokwasami a modelami łańcuchów bocznych reszt aminokwasowych w wodzie - studia teoretyczne
    NAZWA KONFERENCJI: 60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego
    MIEJSCE: Wrocław, 17-21 września 2017
    Typ publikacji: PXK
    Język publikacji: POL
    14/15
    AUTORZY: Adam Liwo, Cezary Czaplewski, Adam K. Sieradzan, Paweł Krupa, Magdalena Mozolewska, Emilia Lubecka, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka G. Lipska, Agnieszka Karczyńska, Łukasz Golon, Bartłomiej Zaborowski, Stanisław Ołdziej.
    TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: UNRES, NARES, and SUGRES Coarse-Grained Models - an introduction
    ŹRÓDŁO: W: Coarse graining of biomolecules and beyond Molecular modeling workshop Saturday, 7 October 2017 : book of abstracts
    OPIS FIZYCZNY: S. 36
    UWAGI: Bibliogr. 5 poz.
    Typ publikacji: ZSZ
    Język publikacji: ENG
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • coarse-grained models
  • UNRES
  • NARES
  • SUGRES

    15/15
    AUTORZY: Chen Keasar, Liam J. McGuffin, Björn Wallner, Gaurav Chopra, Badri Adhikari, Debswapna Bhattacharya, Lauren Blake, Leandro Oliveira Bortot, Renzhi Cao, B. K. Dhanasekaran, Itzhel Dimas, Rodrigo Antonio Faccioli, Eshel Faraggi, Robert Ganzynkowicz, Sambit Ghosh, Soma Ghosh, Artur Giełdoń, Łukasz Golon, Yi He, Lim Heo, Jie Hou, Main Khan, Firas Khatib, George A. Khoury, Chris Kieslich, David E. Kim, Paweł Krupa, Gyu Rie Lee, Hongbo Li, Jilong Li, Agnieszka Lipska, Adam Liwo, Ali Hassan A. Maghrabi, Milot Mirdita, Shokoufeh Mirzaei, Magdalena A. Mozolewska, Melis Onel, Sergey Ovchinnikov, Anand Shah, Utkarsh Shah, Tomer Sidi, Adam K. Sieradzan, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, James Smadbeck, Phanourios Tamamis, Nicholas Trieber, Tomasz Wirecki, Yanping Yin, Yang Zhang, Jaume Bacardit, Maciej Baranowski, Nicholas Chapman, Seth Cooper, Alexandre Defelicibus, Jeff Flatten, Brian Koepnick, Zoran Popović, Bartłomiej Zaborowski, David Baker, Jianlin Cheng, Cezary Czaplewski, Alexandre Cláudio Botazzo Delbem, Christodoulos Floudas, Andrzej Kloczkowski, Stanisław Ołdziej, Michael Levitt, Harold Scheraga, Chaok Seok, Johannes Soeding, Saraswathi Vishveshwara, Dong Xu, Silvia N. Crivelli.
    TYTUŁ: An analysis and evaluation of the WeFold collaborative for protein structure prediction and its pipelines in CASP11 and CASP12
    ŹRÓDŁO: Scientific Reports, [dokument elektroniczny]. - 2018, Vol. 8, art. no. 9939, s. 1-18
    TRYB DOSTĘPU: https://www.nature.com/articles/s41598-018-26812-8.pdf [dostęp 05.10.2018]
    e-ISSN: 2045-2322

    UWAGI: Bibliogr. 36 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 4.122
    Punktacja MNiSW: 40.000
    5-letni Impact Factor ISI: 4.609
    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Medline
  • Scopus

    Adres url:
    DOI:
      Wyświetl ponownie stosując format:
  • Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetlenie wyników w wersji do druku | | Nowe wyszukiwanie | Biblioteka Główna Uniwersytetu Gdańskiego