logo UG

Bibliografia Publikacji Pracowników, Doktorantów i Studentów UG




Zapytanie: ZABOROWSKI BARTŁOMIEJ
Liczba odnalezionych rekordów: 42



Przejście do opcji zmiany formatu | Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetl wyniki w wersji do druku | | Przesłanie wyników do modułu analizy | Nowe wyszukiwanie
1/42
AUTORZY: Ewa Ryłko, Irena Bojanowska, Małgorzata Babiarz, Marcin Gregorowicz, Katarzyna Młynarkiewicz, Bartłomiej Zaborowski.
TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: Badanie zawartości pierwiastków metalicznych i ocena ich biodostępności w glebach gdańskich ogrodów działkowych
TYTUŁ W INNYM JĘZYKU: Investigations of metals contents and bioavailability in Gdańsk allotments soils
ŹRÓDŁO: W: 52. Zjazd Polskiego Towarzystwa Chemicznego oraz Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego, Łódź, 12-16 września 2009 : streszczenia
OPIS FIZYCZNY: S. 197
UWAGI: Bibliogr. 2 poz.
Typ publikacji: PSZ
Język publikacji: POL
2/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Cezary Czaplewski, Adam Liwo, Juyoung Lee, Jooyoung Lee.
TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: A coarse-grained united residue force field and dynamic fragment assembly method using conformationals space annealing algorithm approach to protein structure prediction.
ŹRÓDŁO: W: "Chemia dla środowiska i cywilizacji" : 55 Zjazd Polskiego Towarzystwa Chemicznego i Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego, Białystok, 16-20 września 2012 : materiały zjazdowe.
ADRES WYDAWNICZY: Warszawa : Polskie Towarzystwo Chemiczne, 2012.
OPIS FIZYCZNY: S. 325.
ISBN: 978-83-60988-12-1
UWAGI: Bibliogr. 4 poz.
Typ publikacji: PSZ
Język publikacji: ENG
[sprawdź dostępność w katalogu BUG]
3/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Cezary Czaplewski, Adam Liwo, Juyoung Lee, Jooyoung Lee.
TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: Opitimization of energy-function parameters for the prediction of protein structure by conformational space annealing with the united residues (UNRES) force field and dynamic fragment assembly.
ŹRÓDŁO: W: "Chemia dla środowiska i cywilizacji" : 55 Zjazd Polskiego Towarzystwa Chemicznego i Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego, Białystok, 16-20 września 2012 : materiały zjazdowe.
ADRES WYDAWNICZY: Warszawa : Polskie Towarzystwo Chemiczne, 2012.
OPIS FIZYCZNY: S. 325.
ISBN: 978-83-60988-12-1
UWAGI: Bibliogr. 6 poz.
Typ publikacji: PSZ
Język publikacji: ENG
[sprawdź dostępność w katalogu BUG]
4/42
AUTORZY: Adam Liwo, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Ewa Gołaś, Yi He, Dawid Jagieła, Paweł Krupa, M. Maciejczyk, Mariusz Makowski, Magdalena Mozolewska, A. Niadzvedtski, Stanisław Ołdziej, H. A. Scheraga, Adam K. Sieradzan, Agnieszka Śleszyńska, Rafał Ślusarz, Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A unified coarse-grained model of biological macromolecules based on mean-field multipole-multipole interactions
NAZWA KONFERENCJI: 9th European Conference on Computational Chemistry (EuCo-CC9)
MIEJSCE: Sopron, Hungary, 1-5 September 2013
Typ publikacji: ZXK
Język publikacji: ENG
5/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski.
TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: Metody optymalizacji globalnej w przewidywaniu struktury białek
ŹRÓDŁO: W: Nowe trendy w naukach przyrodniczych 4 : Creative Science - Monografia 2013, t. 1 / pod red.: Marcin Kuczera
ADRES WYDAWNICZY: Kraków : CreativeTime, 2013
OPIS FIZYCZNY: S. 27-34
ISBN: 978-83-63058-31-9
UWAGI: Bibliogr. 32 poz.
Typ publikacji: PMR
Język publikacji: POL
6/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Jooyoung Lee, Cezary Czaplewski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Molecular dynamics and replica exchange simulations of protein folding with dynamic fragment assembly and UNRES force field
NAZWA KONFERENCJI: Biomolecules and Nanostructures 4
MIEJSCE: Pułtusk, Poland, 15-19 May 2013
ORGANIZATOR KONFERENCJI: Institute of Physics, Polish Academy of Sciences (PAS) in Warsaw, Poland ; Pro Physica Foundation
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
7/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Jooyoung Lee, Cezary Czaplewski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Optimization of dynamic fragment assembly for protein structure prediction with conformational space annealing and UNRES force field
NAZWA KONFERENCJI: Biomolecules and Nanostructures 4
MIEJSCE: Pułtusk, Poland, 15-19 May 2013
ORGANIZATOR KONFERENCJI: Institute of Physics, Polish Academy of Sciences (PAS) in Warsaw, Poland ; Pro Physica Foundation
Typ publikacji: ZXP
Język publikacji: ENG
8/42
AUTORZY: Cezary Czaplewski, Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Juyoung Lee, Jooyoung Lee.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction using UNRES force field with Conformational Space Annealing and Dynamic Fragment Assembly
NAZWA KONFERENCJI: Fifth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations
MIEJSCE: High1 Resort, Korea, 24-26 February 2013
Typ publikacji: ZXI
Język publikacji: ENG
9/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Jooyoung Lee, Cezary Czaplewski.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Symulacje zawężania przestrzeni konformacyjnej (CSA) dla białek zawierających D i L aminokwasy w polu siłowym UNRES
NAZWA KONFERENCJI: Konferencja Młodych Naukowców Dokonania naukowe doktorantów, I Edycja
MIEJSCE: Kraków, 20 kwietnia 2013
ORGANIZATOR KONFERENCJI: CreativeTime
Typ publikacji: PXP
Język publikacji: POL
10/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Cezary Czaplewski, Adam Liwo, Juyoung Lee, Jooyoung Lee.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Wprowadzenie metody dynamicznego składania fragmentów (DFA) do symulacji dynamiki molekularnej (MD) dla białek z wykorzystaniem pola siłowego UNRES
NAZWA KONFERENCJI: Konferencja Wpływ Młodych Naukowców na Osiągnięcia Polskiej Nauki, IV Edycja
MIEJSCE: Gdańsk, 12 kwietnia 2013
ORGANIZATOR KONFERENCJI: CreativeTime
Typ publikacji: PXP
Język publikacji: POL
11/42
AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Cezary Czaplewski, Anna Hałabis, Agnieszka Lewandowska, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Adam Liwo.
TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A maximum-likelihood approach to force-field calibration
NAZWA KONFERENCJI: Protein Folding Conference 2014
MIEJSCE: Punta Cana, Dominican Republic, 16-19 July 2014
Typ publikacji: ZXK
Język publikacji: ENG
12/42
AUTORZY: Adam Liwo, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Ewa Gołaś, Yi He, Dawid Jagieła, Paweł Krupa, Maciej Maciejczyk, Mariusz Makowski, Magdalena A. Mozolewska, Andrei Niadzvedtski, Stanisław Ołdziej, Harold A. Scheraga, Adam K. Sieradzan, Rafał Ślusarz, Tomasz Wirecki, Yanping Yin, Bartłomiej Zaborowski.
TYTUŁ: A unified coarse-grained model of biological macromolecules based on mean-field multipole-multipole interactions
ŹRÓDŁO: Journal of Molecular Modeling. - 2014, Vol. 20, no. 8, art. no. 2306, s. 1-15
p-ISSN: 1610-2940
e-ISSN: 0948-5023

UWAGI: Bibliogr. 101 poz.
Typ publikacji: ZAC
Język publikacji: ENG
Wskaźnik Impact Factor ISI: 1.736
Punktacja MNiSW: 25.000
5-letni Impact Factor ISI: 1.711
Słowa kluczowe w j. ang.:
  • coarse-graining
  • mean-field approach
  • multipole-multipole interactions
  • proteins
  • nucleic acids
  • polysaccharides

    Inne bazy podające opis:
  • Medline
  • Scopus
  • Web of Science

    Adres url:
    DOI:
    13/42
    AUTORZY: Krzysztof Żamojć, Wiesław Wiczk, Bartłomiej Zaborowski, Dagmara Jacewicz, Lech Chmurzyński.
    TYTUŁ: Analysis of fluorescence quenching of coumarin derivatives by 4-hydroxy-TEMPO in aqueous solution
    ŹRÓDŁO: Journal of Fluorescence. - 2014, Vol. 24, iss. 3, s. 713-718
    p-ISSN: 1053-0509
    e-ISSN: 1573-4994

    UWAGI: Bibliogr. 33 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 1.927
    Punktacja MNiSW: 25.000
    5-letni Impact Factor ISI: 1.901
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • coumarins
  • 4-hydroxy-TEMPO
  • fluorescence quenching
  • dynamic quenching

    Inne bazy podające opis:
  • Scopus
  • Web of Science

    Adres url:
    DOI:
    14/42
    AUTORZY: Cezary Czaplewski, Bartłomiej Zaborowski, Magdalena Mozolewska, Paweł Krupa, Keehyoung Joo, Jooyoung Lee, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Application of knowledge-based modeling in coarse-grained UNRES simulations
    NAZWA KONFERENCJI: Protein Folding Conference 2014
    MIEJSCE: Punta Cana, Dominican Republic, 16-19 July 2014
    Typ publikacji: ZXK
    Język publikacji: ENG
    15/42
    AUTORZY: Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski.
    TYTUŁ: Dynamika molekularna oraz jej rozszerzenia w polu siłowym UNRES
    ŹRÓDŁO: Dokonania Młodych Naukowców, [dokument elektroniczny]. - 2014, Nr 5, cz. 1, s. 126-127
    TRYB DOSTĘPU: Płyta DVD
    e-ISSN: 2300-4436

    UWAGI: Bibliogr. 11 poz.
    Tytuł-nazwa konferencji: Konferencja Wpływ Młodych Naukowców na Osiągnięcia Nauki Polskiej, VI Edycja
    Miejsce konferencji: Gdańsk
    Kraj: PL
    Od dnia: 2014.04.25
    Do dnia: 2014.04.27
    Typ publikacji: PAC
    Język publikacji: POL
    Słowa kluczowe w j. pol.:
  • UNRES
  • pole siłowe
  • dynamika molekularna
  • REMD

    16/42
    AUTORZY: Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Extension of the UNRES force field with the Multiplex Replica Hybrid Monte Carlo algorithm
    NAZWA KONFERENCJI: From Computational Biophysics to Systems Biology CBSB14
    MIEJSCE: Gdansk, Poland, 25-27 May 2014
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: Uniwersytet Gdański ; University of Oklahoma ; CI TASK ; Pro Science Poland Ltd. ; Innovation Synergy
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    17/42
    AUTORZY: Krzysztof Żamojć, Wiesław Wiczk, Bartłomiej Zaborowski, Mariusz Makowski, Joanna Pranczk, Dagmara Jacewicz, Lech Chmurzyński.
    TYTUŁ: Fluorescence quenching of fluoroquinolone antibiotics by 4-hydroxy-TEMPO in aqueous solution
    ŹRÓDŁO: Spectrochimica Acta. Part A, Molecular and Biomolecular Spectroscopy. - 2014, Vol. 133, s. 887-891
    p-ISSN: 1386-1425
    e-ISSN: 1873-3557

    UWAGI: Bibliogr. 26 poz.
    Tytuł-nazwa konferencji: 12th International Conference on Molecular Spectroscopy
    Miejsce konferencji: Kraków
    Kraj: PL
    Od dnia: 2013.09.08
    Do dnia: 2013.09.12
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 2.353
    Punktacja MNiSW: 30.000
    5-letni Impact Factor ISI: 2.360
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • fluoroquinolone antibiotics
  • 4-hydroxy-TEMPO
  • fluorescence quenching
  • dynamic quenching

    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science

    Adres url:
    DOI:
    18/42
    AUTORZY: Agnieszka Karczyńska, Bartłomiej Zaborowski, Magdalena Ślusarz.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Investigating of interactions between dermorphin analogs and μ-opioid receptor
    NAZWA KONFERENCJI: From Computational Biophysics to Systems Biology CBSB14
    MIEJSCE: Gdansk, Poland, 25-27 May 2014
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: Uniwersytet Gdański ; University of Oklahoma ; CI TASK ; Pro Science Poland Ltd. ; Innovation Synergy
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    19/42
    AUTORZY: Agnieszka Karczyńska, Bartłomiej Zaborowski, Magdalena Ślusarz.
    TYTUŁ: Investigation of interactions between dermorphin analogs and μ-opioid receptor
    ŹRÓDŁO: TASK Quarterly. - 2014, Vol. 18, nr 4, s. 331-336
    p-ISSN: 1428-6394

    UWAGI: Bibliogr. 13 poz.
    UWAGI: Tytuł nru: From computational biophysics to systems biology, pt. II
    Typ publikacji: PAC
    Język publikacji: ENG
    Punktacja MNiSW: 10.000
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • molecular modeling
  • opioid receptors
  • defmorphin
  • molecular docking
  • drug design

    20/42
    AUTORZY: Y. Yin, Adam K. Sieradzan, Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Tomasz Wirecki, Agnieszka Lipska, Anna Hałabis, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Artur Giełdoń, Michał Głuski, Y. He, Dawid Jagieła, Agnieszka Karczyńska, Mariusz Makowski, Marta Wiśniewska, Bartłomiej Zaborowski, H. A. Scheraga, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Performance of the UNRES force field with improved treatment of local and multibody interactions and enhanced conformational search procedure in blind prediction of protein structures
    NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
    MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    21/42
    AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Marta Wiśniewska, Y. Yin, Y. He, Adam K. Sieradzan, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka Lipska, Agnieszka Karczyńska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, Artur Giełdoń, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Michał Głuski, Dawid Jagieła, Adam Liwo, Mariusz Makowski, Stanisław Ołdziej, Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski, H. A. Scheraga.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction by replica-exchange molecular dynamics simulations with the physics-based coarse-grained UNRES force field
    NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
    MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    22/42
    AUTORZY: Magdalena A. Mozolewska, Paweł Krupa, Bartłomiej Zaborowski, Adam K. Sieradzan, Adam Liwo, K. Joo, J. Lee, Rafał Ślusarz, Magdalena Ślusarz, Agnieszka Karczyńska, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction by replica-exchange molecular dynamics simulations with the UNRES force field aided by knowledge-based information
    NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
    MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    23/42
    AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Adam K. Sieradzan, Y. He, Y. Yin, Agnieszka Lipska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, C. Kieslich, J. Smadbeck, G. Khoury, P. Tamamis, C. A. Floudas, Maciej Baranowski, Cezary Czaplewski, Robert Ganzynkowicz, Artur Giełdoń, Adam Liwo, Stanisław Ołdziej, Tomasz Wirecki, Bartłomiej Zaborowski, H. A. Scheraga, S. N. Crivelli.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction by replica-exchange molecular dynamics simulations with the UNRES force field aided by secondary-structure and residue-residue contact prediction
    NAZWA KONFERENCJI: 11th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP11)
    MIEJSCE: Riviera Maya, Mexico, 7-10 December 2014
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    24/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Tomasz Wirecki, Cezary Czaplewski, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Use of maximum likelihood method for calibration of the coarse-grained UNRES force-field
    NAZWA KONFERENCJI: From Computational Biophysics to Systems Biology CBSB14
    MIEJSCE: Gdansk, Poland, 25-27 May 2014
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: Uniwersytet Gdański ; University of Oklahoma ; CI TASK ; Pro Science Poland Ltd. ; Innovation Synergy
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    25/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Cezary Czaplewski, Anna Hałabis, Agnieszka Lewandowska, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Agnieszka Karczyńska, Christian Omieczynski, Tomasz Wirecki, Adam Liwo.
    TYTUŁ: A maximum-likelihood approach to force-field calibration
    ŹRÓDŁO: Journal of Chemical Information and Modeling. - 2015, Vol. 55, iss. 9, s. 2050-2070
    p-ISSN: 1549-9596
    e-ISSN: 1549-960X

    UWAGI: Bibliogr. 91 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 3.657
    Punktacja MNiSW: 40.000
    5-letni Impact Factor ISI: 4.170
    Inne bazy podające opis:
  • Medline
  • Scopus
  • Web of Science

    Adres url:
    DOI:
    26/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Adam Sieradzan, Cezary Czaplewski, Anna Hałabis, Agnieszka Lewandowska, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A maximum-likelihood approach to force-field training for protein structure prediction and folding simulations
    NAZWA KONFERENCJI: 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2015)
    MIEJSCE: Warsaw, Poland, 12-15 April 2015
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    27/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Adam K. Sieradzan, Cezary R. Czaplewski, Anna Hałabis, Agnieszka Lewandowska, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Józef Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: A novel method for force-field calibration based on maximum-likelihood approach and thermal unfolding data
    NAZWA KONFERENCJI: 59th Annual Meeting of the Biophysical Society Bridging the sciences : computation and experiment
    MIEJSCE: Baltimore, MD (USA), 7-11 February 2015
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    28/42
    AUTORZY: Krzysztof Żamojć, Wiesław Wiczk, Bartłomiej Zaborowski, Dagmara Jacewicz, Lech Chmurzyński.
    TYTUŁ: Fluorescence quenching of 7-amino-4-methylcoumarin by different TEMPO derivatives
    ŹRÓDŁO: Spectrochimica Acta. Part A, Molecular and Biomolecular Spectroscopy. - 2015, Vol. 136, pt. C, s. 1875-1880
    p-ISSN: 1386-1425
    e-ISSN: 1873-3557

    UWAGI: Bibliogr. 36 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 2.653
    Punktacja MNiSW: 30.000
    5-letni Impact Factor ISI: 2.582
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • 7-amino-4-methylcoumarin
  • TEMPO derivatives
  • fluorescence quenching
  • dynamic quenching

    Inne bazy podające opis:
  • Scopus
  • Web of Science

    Adres url:
    DOI:
    29/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Adam K. Sieradzan, Cezary Czaplewski, Anna Hałabis, Agnieszka Lewandowska, Wioletta Żmudzińska, Stanisław Ołdziej, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Maximum-likelihood calibration of force fields
    NAZWA KONFERENCJI: The First Korean-Polish Conference on Protein folding: theoretical and experimental approaches
    MIEJSCE: Seoul, Korea, 24-28 May 2015
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS; University of Gdańsk
    Typ publikacji: ZXI
    Język publikacji: ENG
    30/42
    AUTORZY: Magdalena A. Mozolewska, Paweł Krupa, Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, K. Joo, J. Lee, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Performance of UNRES aided by knowledge-based information in CASP11
    NAZWA KONFERENCJI: The First Korean-Polish Conference on Protein folding: theoretical and experimental approaches
    MIEJSCE: Seoul, Korea, 24-28 May 2015
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS; University of Gdańsk
    Typ publikacji: ZXK
    Język publikacji: ENG
    31/42
    AUTORZY: Cezary Czaplewski, Bartłomiej Zaborowski, Magdalena Mozolewska, Paweł Krupa, Keehyoung Joo, Jooyoung Lee, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Template-based modeling combined with the coarse-grained UNRES simulations
    NAZWA KONFERENCJI: The First Korean-Polish Conference on Protein folding: theoretical and experimental approaches
    MIEJSCE: Seoul, Korea, 24-28 May 2015
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS; University of Gdańsk
    Typ publikacji: ZXI
    Język publikacji: ENG
    32/42
    AUTORZY: Bartłomiej Zaborowski, Cezary Czaplewski, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: The influence of parameters controlling thermostats on the folding of proteins using UNRES force field
    NAZWA KONFERENCJI: The First Korean-Polish Conference on Protein folding: theoretical and experimental approaches
    MIEJSCE: Seoul, Korea, 24-28 May 2015
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS; University of Gdańsk
    Typ publikacji: ZXP
    Język publikacji: ENG
    33/42
    AUTORZY: Adam Liwo, Cezary Czaplewski, Stanisław Ołdziej, Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Jooyoung Lee.
    TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: Chemoinformatics methods for studying biomolecules
    ŹRÓDŁO: W: Handbook of computational chemistry / Jerzy Leszczyński ed.
    ADRES WYDAWNICZY: Dordrecht : Springer Netherlands, 2016
    OPIS FIZYCZNY: S. 1-17
    ISBN: 978-94-007-6169-8 (online)
    UWAGI: Bibliogr. 63 poz.
    Typ publikacji: ZMR
    Język publikacji: ENG
    Punktacja MNiSW: 5.000
    DOI:
    34/42
    AUTORZY: Paweł Krupa, Magdalena A. Mozolewska, Marta Wiśniewska, Yanping Yin, Yi He, Adam K. Sieradzan, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka G. Lipska, Agnieszka Karczyńska, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, Artur Giełdoń, Cezary Czaplewski, Dawid Jagieła, Bartłomiej Zaborowski, Harold A. Scheraga, Adam Liwo.
    TYTUŁ: Performance of protein-structure predictions with the physics-based UNRES force field in CASP11
    ŹRÓDŁO: Bioinformatics. - 2016, Vol. 32, iss. 21, s. 3270-3278
    p-ISSN: 1367-4803
    e-ISSN: 1460-2059

    UWAGI: Bibliogr. 62 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 7.307
    Punktacja MNiSW: 45.000
    5-letni Impact Factor ISI: 8.044
    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Medline
  • Scopus

    DOI:
    35/42
    AUTORZY: Agnieszka S. Karczyńska, Magdalena A. Mozolewska, Paweł Krupa, Krzysztof [chemia] Bojarski, Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Rafał Ślusarz, Magdalena Ślusarz, J. Lee, K. Joo, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction with the UNRES force field aided by knowledge-based information
    NAZWA KONFERENCJI: 12th meeting Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP12)
    MIEJSCE: Gaeta, Italy, 10-13 December 2016
    Typ publikacji: ZXK
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    36/42
    AUTORZY: Magdalena A. Mozolewska, Paweł Krupa, Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Jooyoung Lee, Keehyoung Joo, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ: Use of restraints from consensus fragments of multiple server models to enhance protein-structure prediction capability of the UNRES force field
    ŹRÓDŁO: Journal of Chemical Information and Modeling. - 2016, Vol. 56, iss. 11, s. 2263-2279
    p-ISSN: 1549-9596
    e-ISSN: 1549-960X

    UWAGI: Bibliogr. 75 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 3.760
    Punktacja MNiSW: 40.000
    5-letni Impact Factor ISI: 4.066
    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Scopus
  • Medline

    Adres url:
    DOI:
    37/42
    AUTORZY: Adam Liwo, Cezary Czaplewski, Stanisław Ołdziej, Bartłomiej Zaborowski, Dawid Jagieła, Jooyoung Lee.
    TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: Chemoinformatics methods for studying biomolecules
    ŹRÓDŁO: W: Handbook of computational chemistry / Jerzy Leszczynski, ed. ; Anna Kaczmarek-Kedziera, Tomasz Puzyn, Manthos G. Papadopoulos, Heribert Reis, Manoj K. Shukla, co-eds
    OZNACZENIE WYDANIA: Second edition
    ADRES WYDAWNICZY: Cham : Springer, 2017
    OPIS FIZYCZNY: S. 2183-2199
    ISBN: 978-3-319-27281-8
    ISBN: 978-3-319-27282-5 (eBook)
    ISBN: 978-3-319-28572-6
    UWAGI: Bibliogr. 63 poz.
    Typ publikacji: ZMR
    Język publikacji: ENG
    Adres url:
    DOI:
    38/42
    AUTORZY: Cezary Czaplewski, Agnieszka Karczyńska, Artur Giełdoń, Magdalena Mozolewska, Paweł Krupa, Bartłomiej Zaborowski, Jooyoung Lee, Keehyoung Lee, Adam Liwo.
    TYTUŁ WYSTĄPIENIA: Protein structure prediction with the UNRES force field aided by restraints from consensus fragments of multiple server models
    NAZWA KONFERENCJI: Third Korean-Polish Conference on Protein Folding: Theoretical and Experimental Approaches
    MIEJSCE: Korea, 5-9 February 2017
    ORGANIZATOR KONFERENCJI: KIAS ; University of Gdańsk
    Typ publikacji: ZXI
    Język publikacji: ENG
    39/42
    AUTORZY: Krzysztof Żamojć, Magdalena Zdrowowicz, Paweł Błażej Rudnicki-Velasquez, Karol Krzymiński, Bartłomiej Zaborowski, Paweł Niedziałkowski, Dagmara Jacewicz, Lech Chmurzyński.
    TYTUŁ: The development of 1,3-diphenylisobenzofuran as a highly selective probe for the detection and quantitative determination of hydrogen peroxide
    ŹRÓDŁO: Free Radical Research. - 2017, Vol. 51, iss. 1, s. 38-46
    p-ISSN: 1071-5762
    e-ISSN: 1029-2470

    UWAGI: Bibliogr. 21 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 3.038
    Punktacja MNiSW: 25.000
    5-letni Impact Factor ISI: 3.136
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • 1,3-diphenylisobenzofuran
  • hydrogen peroxide
  • fluorescence spectroscopy
  • high performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry
  • selectivity
  • limit of detection and quantitation

    Inne bazy podające opis:
  • Scopus
  • Web of Science
  • Medline

    DOI:
    40/42
    AUTORZY: Adam Liwo, Cezary Czaplewski, Adam K. Sieradzan, Paweł Krupa, Magdalena Mozolewska, Emilia Lubecka, Robert Ganzynkowicz, Agnieszka G. Lipska, Agnieszka Karczyńska, Łukasz Golon, Bartłomiej Zaborowski, Stanisław Ołdziej.
    TYTUŁ [ROZDZIAŁU, FRAGMENTU]: UNRES, NARES, and SUGRES Coarse-Grained Models - an introduction
    ŹRÓDŁO: W: Coarse graining of biomolecules and beyond Molecular modeling workshop Saturday, 7 October 2017 : book of abstracts
    OPIS FIZYCZNY: S. 36
    UWAGI: Bibliogr. 5 poz.
    Typ publikacji: ZSZ
    Język publikacji: ENG
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • coarse-grained models
  • UNRES
  • NARES
  • SUGRES

    41/42
    AUTORZY: Chen Keasar, Liam J. McGuffin, Björn Wallner, Gaurav Chopra, Badri Adhikari, Debswapna Bhattacharya, Lauren Blake, Leandro Oliveira Bortot, Renzhi Cao, B. K. Dhanasekaran, Itzhel Dimas, Rodrigo Antonio Faccioli, Eshel Faraggi, Robert Ganzynkowicz, Sambit Ghosh, Soma Ghosh, Artur Giełdoń, Łukasz Golon, Yi He, Lim Heo, Jie Hou, Main Khan, Firas Khatib, George A. Khoury, Chris Kieslich, David E. Kim, Paweł Krupa, Gyu Rie Lee, Hongbo Li, Jilong Li, Agnieszka Lipska, Adam Liwo, Ali Hassan A. Maghrabi, Milot Mirdita, Shokoufeh Mirzaei, Magdalena A. Mozolewska, Melis Onel, Sergey Ovchinnikov, Anand Shah, Utkarsh Shah, Tomer Sidi, Adam K. Sieradzan, Magdalena Ślusarz, Rafał Ślusarz, James Smadbeck, Phanourios Tamamis, Nicholas Trieber, Tomasz Wirecki, Yanping Yin, Yang Zhang, Jaume Bacardit, Maciej Baranowski, Nicholas Chapman, Seth Cooper, Alexandre Defelicibus, Jeff Flatten, Brian Koepnick, Zoran Popović, Bartłomiej Zaborowski, David Baker, Jianlin Cheng, Cezary Czaplewski, Alexandre Cláudio Botazzo Delbem, Christodoulos Floudas, Andrzej Kloczkowski, Stanisław Ołdziej, Michael Levitt, Harold Scheraga, Chaok Seok, Johannes Soeding, Saraswathi Vishveshwara, Dong Xu, Silvia N. Crivelli.
    TYTUŁ: An analysis and evaluation of the WeFold collaborative for protein structure prediction and its pipelines in CASP11 and CASP12
    ŹRÓDŁO: Scientific Reports, [dokument elektroniczny]. - 2018, Vol. 8, art. no. 9939, s. 1-18
    TRYB DOSTĘPU: https://www.nature.com/articles/s41598-018-26812-8.pdf [dostęp 05.10.2018]
    e-ISSN: 2045-2322

    UWAGI: Bibliogr. 36 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 4.122
    Punktacja MNiSW: 40.000
    5-letni Impact Factor ISI: 4.609
    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Medline
  • Scopus

    Adres url:
    DOI:
    42/42
    AUTORZY: Agnieszka Karczyńska, Magdalena A. Mozolewska, Paweł Krupa, Artur Giełdoń, Krzysztof [chemia] Bojarski, Bartłomiej Zaborowski, Adam Liwo, Rafał Ślusarz, Magdalena Ślusarz, Jooyoung Lee, Keehyoung Joo, Cezary Czaplewski.
    TYTUŁ: Use of the UNRES force field in template-assisted prediction of protein structures and the refinement of server models: Test with CASP12 targets
    ŹRÓDŁO: Journal of Molecular Graphics and Modelling. - 2018, Vol. 83, s. 92-99
    p-ISSN: 1093-3263
    e-ISSN: 1873-4243

    UWAGI: Bibliogr. 36 poz.
    Typ publikacji: ZAC
    Język publikacji: ENG
    Wskaźnik Impact Factor ISI: 1.885
    Punktacja MNiSW: 25.000
    5-letni Impact Factor ISI: 1.806
    Słowa kluczowe w j. ang.:
  • protein structure prediction
  • UNRES force field
  • knowledge-based methods
  • template-based restraints
  • replica exchange molecular dynamics

    Inne bazy podające opis:
  • Web of Science
  • Scopus

    Adres url:
    DOI:
      Wyświetl ponownie stosując format:
  • Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetlenie wyników w wersji do druku | | Nowe wyszukiwanie | Biblioteka Główna Uniwersytetu Gdańskiego